《道书十二种》为清乾嘉时龙门派道士刘一明所撰之道教丛书。有清嘉庆二十四年 （1819）常郡护国庵刊本；民国二年（1913）上海江东书局石印本；民国十四年（1925） 上海集成书局石印本；中国中医药出版社据常郡护国庵本，并以上海翼化堂本校勘补缺， 于1990年7月出版之影印本，是目前之最佳本。原名《指南针》，收书十二种，后收书增 加，但仍沿袭此名。现共收书十七种。刘一明所作之书，除《道德经会要》《心经解蕴》 《金丹口诀》《栖云笔记》，及医书《经验杂方》《经验奇方》《眼科启蒙》《杂疫症 治》等未收入外，全都汇集在此丛书内。
所收十七种书，可概分为两类。一为注释。计有：《易理阐真》含《周易阐真》五 卷，《孔易阐真》二卷），《阴符经注》一卷，《参同直指》（含《参同契经文直指》 三卷，《参同契直指笺注》三卷，《参同契直指三相类》二卷），《黄庭经解》一卷， 《百字碑注》（附《黄鹤赋》）一卷，《敲爻歌直解》一卷，《悟真直指》四卷，《金 丹四百字解》一卷，《无根树解》一卷，共九种。一为撰者。计有：《修真辨难》《修 真后辨》各一卷，《修真九要》一卷，《通关文》二卷，《神室八法》一卷，《象言破 疑》二卷，《会心集》（含《会心内集》二卷，《会心外集》二卷），《西游原旨》一 卷，《悟道录》二卷，共八种。
九种注释书中，后七种为丹经注释。前两种之一的《阴符经》，亦被刘一明视为最 古之丹经，以丹道注释之，这与唐宋以后之内丹家无异。别具特色的是对《易》的注释 《易理阐真》。《易》被儒家定为六经之首，一般人认其为儒家书；但刘一明认为， 《易》之“归根处，总以穷理尽性至命为学”。故断定：“《易》非卜筮之书，乃穷理 尽性至命之学也。”在他看来，“丹道即易道，圣道即仙道”，①儒家易学与道教丹学 是二而一者的。故他把《易》作为丹经来加以阐释。另一方面，他又认为：“丹经子书， 千帙万卷，总不外易理。”②实际又把《易》作为丹经祖书之一。因此他不仅在注《易》 时，以丹道解易学，以易学证丹道，而且在注释其他丹经和撰写其他丹书时，亦多以 《易》学为本。丹道与《易》学的紧密结合是刘一明内丹理论的特点之一。
八种撰著书，是刘一明内丹理论和方法的直接表述。《修真辨难》（卷上）之后， 又作《修真后辨》（卷下）。前者以师徒问答形式，回答了“何为道”、“阴阳何以分 内外”，以及“玄关一窍”、“内药外药”、“真铅真汞”等一系列问题，“其中天道 圣功，性命源流，药火是非，无不一一分晰”。③后恐前者“头绪散涣，语句冗繁，阅 者不能会通一贯”，特再作后者，将内丹要领集中为二十六条，详加阐释。计有：先天 精、气、神，后天精、气、神，先天真一之气，真假身心，真假性命等。《修真九要》 提出修丹的九个要点与步骤，计有：勘破世事、积德修行、尽心穷理、访求真师、炼己 筑基、和合阴阳、审明火候、外药了命、内药了性等，包括了“功”、“行”两方面的 内容。为了使人勘破世事，又作《通关文》，将世人最难勘破的世事，概括为五十关 （如色欲关、恩爱关、荣贵关、财利关等），劝人一一勘破，以为修丹悟道的起步。从 中反映出强烈的佛教思想色彩。刘一明认为修丹的根本在修心，把人心称作神室，特作 《神室八法》，劝人把刚、柔、诚、信、和、静、虚、灵等八种德性作为建筑神室的材 料，以为修丹的基础。从中又表现出浓厚的糅合儒家理学的色彩。《象言破疑》会合 《易》理，以丹道图数十幅，配合解说修丹的义理，重要者有：象言说、顺逆说、火候 说、胎中面目、婴儿面目、炼己筑基、天良真心、阴阳混合、太空虚无等题，借以“细 分是非，扫旁门而指正道，息邪说而辩真宗”。