第一军医大学坐落在风景秀丽的广州市白云山东麓,占地面积68万平方米，是一所布局合理、环境优雅的全国重点高等院校。
学校以“团结、求实、开拓、奉献”为校训，经过近半个世纪的艰苦创业，已发展成一所综合性医科大学。形成了临床医学、中医学、中药学、医学影像工程、医学影像学、放射技术、医学实验技术、护理学等近10个专业，具有学士（医学和工学）、硕士、博士三级学位授予权的办学体系。建校以来为部队培养了一大批优秀医务人才，其中博士、硕士毕业生1000多人。毕业学员陈大新、温端生分别被中央军委和南京军区授予“雷锋式的模范军医”和“白求恩式的好军医”荣誉称号。 学校现有41个学科（专业）具有硕士学位授予权，13个学科（专业）具有博士学位授予权。学校注重内涵发展，加强质量建设，组建了热带医学、理工医结合、中西医药结合和生物高技术四个特色学科群。
学校师资力量雄厚。现有科技干部近3000人。其中教授、副教授近700名，博士生导师32名，硕士生导师200多名。有100名专家教授分别担任全军和全国性学术组织理事、常委以上职务，有4名专家教授受聘在国际学术组织任职。3人为国家级有突出贡献的中青年专家，近百人享受政府特殊津贴，22名中青年人才分别被评为，“全国百名中青年医学科技之星”，总后首届科技金星、新星和获得“中国青年科技奖”，广东省“丁颖科技奖”。
学校坚持以教育的“三个面向”为指导，认真贯彻新时期军事战略方针，全面深化教学改革，基本形成了理工医结合，中西医结合两大教学特色，教学质量不断提高。近年来，共承担国家、军队教育研究课题20多项，获各级优秀教学成果奖70多项。图书馆藏书达41万余册，中外期刊2300多种，能进行光盘网络检索和卫星介导的图书数据库信息检索。电化教学硬件成网、软件配套，教学实用，建成电教标准化教室24间，多媒体教室2间。计算机教学已实现网络化，并已建成校园信息网络，基本实现军内外图书信息资源共享。
学校科研工作发展势头强劲，科研竞争实力明显增强。“八五”期间共承担世界卫生组织、国家、军队及广东省的重大科研项目400多项，获得省部级以上科技成果奖300余项，其中二等奖以上成果近70项。在临床应用解剖学、泪液学、病毒性肝炎、头胸导联心电学、自由基医学、战创伤休克防治、医学图像等研究方面，都取得了可喜的成就。“八五”期间，全校发表学术论文5000多篇，出版各类专著100余部，编辑出版的《第一军医大学学报》、《中国临床应用解剖学杂志》、《现代消化病及内镜杂志》、《南方护理杂志》和《医学物理》等杂志向全国发行，得到学术界的普遍好评。
学校与国外开展了广泛的学术交流。先后与美国、英国、日本、法国、澳大利亚及香港等10多个国家和地区的大学或科研机构开展了合作研究和学术联系，一些外国专家学者也经常来校讲学、参观访问。
2所综合性教学医院共展开床位2400张，“八五”以来，开展新技术、新业务300多项，特别在内窥镜诊疗、心血管介入诊治、血液净化、器官移植、低温冷冻治疗腰背痛等方面，具有明显的特色和优势。1994年同时被评为三级甲等医院。为港澳台同胞、海外侨胞和国外友人治病查体的惠侨楼和谊侨楼，以精湛的技术、高尚的医德、优质的服务饮誉海内外。1995年3月14日，中央军委江泽民主席签署命令，授予惠侨楼“模范医疗惠侨科”荣誉称号，并亲笔题词：“救死扶伤，无私奉献，艰苦奋斗，永葆本色”。1996年，惠侨楼成为我军首家涉外医疗中心。
改革开放以来，学校坚持以“科学技术是第一生产力”为理论依据，充分利用人才密集、知识密集、技术密集和信息密集的优势，实行教学、医学、科研与生产相结合，重点围绕“医”和“药”，积极开拓科技市场，取得了显著的社会效益和经济效益，加速了学校的现代化建设，使以教学为中心的各项工作走向良性循环，保证了多出人才，多出成果。学校将改革开放后的办学实践，系统总结为“一体两环”的新型办校模式，并于1993年获得全国优秀教学成果一等奖。目前，学校正以军委新时期军事战略方针为标杆，全面贯彻党的教育方针，按照“政治合格、军事过硬、作风优良、纪律严明、保障有力”的总要求，坚持以教学为中心，解放思想，抓住机遇，深化改革，为培养国防建设需要的合格人才而努力奋斗。
根据中央军委总后勤部、教育部的指示，中国人民解放军第一军医大学于2004年8月24日整体移交广东省，永远地脱下了军装，并更名为南方医科大学。
虽然学校结束了军旅之路，但是她将在教书育人的道路上永远向前走下去。