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1)  DNA methylome
基因组DNA甲基化谱
2)  global DNA methylation
基因组DNA甲基化
1.
A sensitive and precise method for the quantification of global DNA methylation level in human colon cancer tissues was developed by liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry with multiple reaction monitoring(MRM) mode under optimized conditions.
利用多重监测反应模式(MRM),通过对液相色谱及质谱条件的优化,建立了人体结肠癌组织样品中基因组DNA甲基化的高效液相色谱-电喷雾质谱(HPLC-ESIMS/MS)检测方法,对结肠癌组织及癌旁组织中基因组DNA甲基化进行了检测。
3)  genome DNA
基因组DNA
1.
Comparing two kinds of methods for extraction of human genome DNA from whole blood;
两种全血基因组DNA提取方法的比较
2.
Production Procedure of Mycobacterium bovis BCG Genome DNA;
卡介菌基因组DNA制备工艺研究
3.
A improved method for extracting bee s genome DNA;
蜜蜂基因组DNA提取方法的改良
4)  genomic DNA
基因组DNA
1.
Effect of cholesterol on genomic DNA methylation level of human vascular endothelial cells;
胆固醇对血管内皮细胞基因组DNA甲基化的影响
2.
Extraction of Genomic DNA from Lycium bararum and Its Fingerprint Analysis;
枸杞基因组DNA提取及指纹图谱分析
3.
Isolation and Analysis of Genomic DNA from Leaves of Corydalis saxicola Bunting;
濒危植物岩黄连叶片中基因组DNA的提取及分析
5)  genomic DNA
基因组 DNA
6)  DNA methylation
DNA甲基化
1.
DNA methylation and autoimmune diseases;
DNA甲基化与自身免疫性疾病
2.
Microarray-based methods to identify DNA methylation in cancer;
芯片技术与肿瘤中DNA甲基化研究
3.
Relationship of nutrition with cancer and its epigenetic DNA methylation mechanism;
营养与肿瘤表观遗传学关系的研究进展——DNA甲基化机制
补充资料:Dna甲基化

dna甲基化(dna methylation)

在甲基转移酶的催化下,dna的cg两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基,形成5甲基胞嘧啶,这常见于基因的5'-cg-3'序列。大多数脊椎动物基因组dna都有少量的甲基化胞嘧啶,主要集中在基因5'端的非编码区,并成簇存在。甲基化位点可随dna的复制而遗传,因为dna复制后,甲基化酶可将新合成的未甲基化的位点进行甲基化。dna的甲基化可引起基因的失活。

结构基因含有很多cpg 结构, 2cpg 和2gpc 中两个胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且两个甲基集团在dna 双链大沟中呈特定三维结构。基因组中60%~ 90% 的cpg 都被甲基化, 未甲基化的cpg 成簇地组成cpg 岛, 位于结构基因启动子的核心序列和转录起始点。有实验证明超甲基化阻遏转录的进行。dna 甲基化可引起基因组中相应区域染色质结构变化, 使dna 失去核酶ö限制性内切酶的切割位点, 以及dna 酶的敏感位点, 使染色质高度螺旋化, 凝缩成团, 失去转录活性。5 位c 甲基化的胞嘧啶脱氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能导致基因置换突变, 发生碱基错配: t2g, 如果在细胞分裂过程中不被纠正,就会诱发遗传病或癌症, 而且, 生物体甲基化的方式是稳定的, 可遗传的。

dna 甲基转移酶有两种: 1) dnm t1, 持续性dna 甲基转移酶—— 作用于仅有一条链甲基化的dna 双链, 使其完全甲基化, 可参与dna 复制双链中的新合成链的甲基化,dnm t1 可能直接与hdac (组蛋白去乙酰基转移酶) 联合作用阻断转录; 2)dnm t3a、dnm t3b从头甲基转移酶, 它们可甲基化cpg, 使其半甲基化, 继而全甲基化。从头甲基转移酶可能参与细胞生长分化调控, 其中dnm t3b在肿瘤基因甲基化中起重要作用。

dna 去甲基化有两种方式: 1) 被动途径: 由于核因子n f 粘附甲基化的dna , 使粘附点附近的dna不能被完全甲基化, 从而阻断dnm t1 的作用; 2) 主动途径: 是由去甲基酶的作用, 将甲基集团移去的过程。在dna 甲基化阻遏基因表达的过程中, 甲基化cpg 粘附蛋白起着重要作用。虽然甲基化dna 可直接作用于甲基化敏感转录因子e2f、creb、a p2、cm ycöm yn、n f2kb、cmyb、ets, 使它们失去结合dna 的功能从而阻断转录, 但是, 甲基化cpg 粘附分子可作用于甲基化非敏感转录因子(sp1、ctf、yy1) , 使它们失活, 从而阻断转录。人们已发现5 种带有恒定的甲基化dna 结合域(mbd ) 的甲基化cpg 粘附蛋白。其中m ecp2、mbd1、mbd2、mbd3 参与甲基化有关的转录阻遏;mbd1 有糖基转移酶活性, 可将t 从错配碱基对tög 中移去,mbd4 基因的突变还与线粒体不稳定的肿瘤发生有关。在mbd2 缺陷的小鼠细胞中, 不含m ecp1 复合物, 不能有效阻止甲基化基因的表达。这表明甲基化cpg 粘附蛋白在dna 甲基化方式的选择, 以及dna 甲基化与组蛋白去乙酰化、染色质重组相互联系中的有重要作用。

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参考词条