日本航空自卫队主要由航空兵、防空导弹及雷达警戒部队组成。编制定员4.72万人，实有兵员4.53万人。

航空部队：现编1个航空总队、3个航空方面队、1个航空混成团、6个战斗航空团)、6个防空导弹群、1个航空支援集团、1个航空教育集团、2个训练航空团、3个飞行教育团、1个航空开发实验集团。

航空自卫队装备各型飞机1000架左右。其中f-15j战斗机186架、f4-ej战斗机111架、f-1战斗机73架，f-2a/b战斗机60架；运输机90架，主要有c-130h、ys-11运输机，ch-47运输直升机等；t-1初级教练机36架、t-2高级教练机48、t-3初级教练机36架、t-4中级教练机126架；预警、侦察、电子干扰、救护飞机约75架、主要有e-2c预警机，rf-4e/ej战术侦察机（26架），ec-1电子干扰机，ys-11e（l）、t-2、t-4教练机等。现有飞行员1800余人，战斗机飞行员年均飞行时间160小时以上。

防空导弹部队：编有6个防空导弹群，辖24个导弹队，装备引进美国技术生产的“爱国者”防空导弹发射装置120部。19个基地防空队，装备81式近程防空导弹发射架34套，“毒刺”和91式单兵防空导弹发射器400余具，20毫米“密集阵”高射炮300余门。

雷达警戒部队：由28个警戒群和12个机动警戒队组成。

日航空自卫队根据其战略环境将领空划分为北、中、西、西南四个防区。

北部防区 包括北海道和本州部队地区。部署有2个战斗航空团，90余架战斗机；2个防空导弹群，40部“爱国者”导弹发射架；1个警戒航空队，13架e-2c预警机；1个航空警戒管制团，9个警戒群和4个机动警戒队，13部雷达。

中部防区 包括本州大部和四国部分地区，首都东京位于该区域内。部署有2个战斗航空团、100余架战斗机；2个防空导弹群，40部“爱国者”导弹发射架；8个警戒群和4个机动警戒队，12部雷达。

西部防区 包括本州西部、四国大部和九州全部。部署有2个战斗航空团，100余架战斗机；1个防空导弹群，20部“爱国者”导弹发射架；7个警戒群和3个机动警戒队，10部雷达。

西南部防区 包括冲绳及周围大小岛屿。由于该防区驻扎较多美军兵力，日航空自卫队在该区只部署1个飞行队，30架战斗机；1个防空导弹群，20部“爱国者”导弹发射架，4个警戒群和1个机动警戒队，5部雷达。

日本航空自卫队是美制f-15战机的最大海外用户，自1980年开始日本就引进该型战机，由三菱重工负责全机的组装，生产单座的f-15j战机和双座的f-15dj战斗教练机。预计最后的总生产量可达224架。