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1) cDNA microarray
cDNA表达谱芯片
1.
Identification of initiative activation related genes of hepatic stellate cell by combining SSH and cDNA microarray;
联合应用SSH和cDNA表达谱芯片筛选肝星状细胞早期活化的相关基因
2) cDNA expression microarray
cDNA表达芯片
1.
To generate a global profile of genes silenced by hypermethylation in NPC cell, we analyzed genes reactivated in the NPC cell lines CNE2 and HONE1 after treatment with the 5-aza-dC and TSA by cDNA expression microarray-based.
为大规模筛选出鼻咽癌中因高甲基化而失活的肿瘤抑制基因,我们利用高通量的cDNA表达芯片技术,以甲基转移酶抑制剂联合脱乙酰基酶抑制剂处理鼻咽癌细胞株CNE2和HONE1,分别与未经处理的细胞株进行差异表达的基因的筛选。
3) cDNA gene chip
cDNA基因表达谱芯片
4) cDNA microarry
cDNA表达谱基因芯片
5) microarray
表达谱芯片
1.
The mixed probes were then hybridized to the cDNA microarray MGEC-80s.
7细胞的mRNA分别标记成探针,混合后与小鼠基因表达谱芯片杂交,通过扫描、计算机分析,寻找经CpG-ODN刺激后差异表达的基因。
2.
Methods: MicroRNA microarray was applied to detect the microRNA expression profile of human tongue squamous cell carcinoma cell line Tca8113 and its drug resistant model Tca8113/CDDP.
方法:应用microRNA表达谱芯片对人舌鳞癌细胞系Tca8113及其耐药模型Tca8113/CDDP的microRNA表达谱进行检测,筛选出人舌鳞癌耐药相关的microRNA;应用real-time PCR方法对microRNA表达谱芯片检测出的差异表达microRNA进行验证:应用化学合成法对筛选出的差异表达microRNA进行体外合成,转染至Tca8113/CDDP耐药模型,观察其对逆转耐药性的作用。
3.
Methods:MicroRNA microarray was applied to detect the microRNA expression profile of human tongue squamous cell carcinoma cell line Tca8113 and its drug resistant model Tca8113/CDDP.
方法:应用microRNA表达谱芯片对人舌鳞癌细胞系Tca8113及其耐药模型Tca8113/CDDP的microRNA表达谱进行检测,筛选出人舌鳞癌耐药相关的microRNA;应用real-time PCR方法对microRNA表达谱芯片检测出的差异表达microRNA进行验证;应用化学合成法对筛选出的差异表达microRNA进行体外合成,转染至Tca8113/CDDP耐药模型,观察其对逆转耐药性的作用。
6) cDNA microarray
表达谱芯片
1.
A study on differently expressed genes in primary varicose vein by cDNA microarray;
用基因表达谱芯片筛选原发性下肢静脉曲张相关基因的研究
2.
The probes were hybridized to the cDNA microarray which contains a set of 14000 human genes.
方法:分别提取10对子宫肌瘤及肌层组织mRNA,用Cy5-dCTP和Cy3-dCTP逆转录标记cDNA探针,然后与含14000条cDNA的表达谱芯片进行杂交,洗片。
3.
OBJECTIVE TO SCREEN DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES IN THE DEVELOPMENT OF HUMAN GLIOMA AND ESTABLISH MOLECULAR CLASSIFICATION OF GLIOMA PRELIMINARY BASED ON GENE EXPRESSION USING CDNA MICROARRAY.
方法 用含 13939种人类基因的BioStarH14 0S型表达谱芯片 ,以正常脑组织及胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片 ;ScanArray 4 0 0 0扫描芯片 ,提取正常脑组织及胶质瘤组织差异基因并行生物信息分析 ,对部分新基因行Northern杂交、原位杂交等功能研究 ;Hierarchical聚类对差异基因进行特征提取 ,进行初步胶质瘤分子病理分类。
补充资料:表达谱差异分析
表达谱差异分析(differential expression profiling)主要包括基因表达谱(gene expression profiling) 和蛋白质表达谱(protein expression profiling) 。大规模表达谱分析已经成为认识疾病分子机制的有利方法,在癌症研究等方面取得了一定的进展。成功的表达谱分析基于实验及其过程分析的有机结合。实验过程从关注的疾病开始,首先收集大量的疾病相关组织样本,样本数量可从10 多个到数百个,但必须足以对每一组织类型及个体差异进行比较分析,而且许多情况下不能仅简单地分为正常和疾病组织。例如,在对糖尿病的研究中,所收集的样本来自健康人、胰岛素耐受和糖尿病病人的不同试验阶段,如胰岛素治疗前后。样品还应包括其他器官的取材,以便进行基因表达的组织分布研究。为了便于对后来的实验数据进行分析管理,需采集并储存所有的组织样本和临床参数。接下来进行组织样本的处理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cdna 芯片或全基因组芯片) 进行表达谱测定,并进行生物信息学分析。 通常,表达谱的分析结果需进一步的实验加以证实。定量rt2pcr 是最灵敏的确证方法,该方法还可以将确证实验的范围扩大到原测组织以外的更广泛的组织和组织类型,揭示基因表达的组织分布情况。 确证实验揭示了疾病相关基因。据此,可以进行进一步研究,探索这些基因的功能,开发新的治疗手段。例如,对于正常和疾病组织中表达有显著性变化的基因,可以进行新治疗靶点的鉴定和确定研究,或利用实验和分析工具研究分析其功能;对于疾病组织中活性升高的酶,可以当作前药活化酶进行鉴定研究。典型的表达谱能够显示疾病过程中有大量的已知基因表达的改变,而许多已知基因的代谢通路、表达产物酶学分类和蛋白质功能业已发表,将两者对照分析,可以鉴定出酶活性,选择其中可能成为前药活化酶的部分进行进一步研究;对于疾病特异的蛋白质,可以进行抗原表型分析,决定疫苗的开发策略。 寻找差异表达基因的方法除芯片技术外,一些新的检测方法如差异显示pcr ( differential display pcr, dd-pcr) 、消减杂交( suppression subreactive hy bridization , ssh) 等也相继得到结合应用。
说明:补充资料仅用于学习参考,请勿用于其它任何用途。
参考词条
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