1) LigScore2
LigScore2打分函数
1.
The binding affinities of the receptor and ligands were evaluated by the LigScore2 score function,where a good linear relationship between the scores and the experimental affinities was established.
得到的模型结果用于训练集的分子对接,采用LigScore2打分函数对小分子与蛋白结合力的预测与评价,所得的结果与其实际活性拟合度较好,说明我们构建的拮抗状态下的A1受体的三维结构模型比较合理,可以作为化合物虚拟筛选的模型对化合物进行虚拟筛选及抑制剂结合模式的研究。
2) Scoring function
打分函数
1.
The scoring function of Bayesian network structure is developed.
给出了变量之间k阶分类能力的概念及计算方法,并证明了k阶分类能力就是k阶分类正确率,以及k阶分类能力和条件独立性的等价性,在此基础上构造出基于分类能力的贝叶斯网络结构打分函数,同时结合依赖分析方法和打分-搜索方法建立了有效的贝叶斯网络结构学习方法,实验结果显示该方法能够有效地进行贝叶斯网络结构学习,并使学习得到的结构倾向于简单化。
2.
The content of the thesis contain the following major aspects:(1) Study on the scoring function of protein molecular dockingTwo scoring functions were proposed.
论文内容主要包括以下几个方面:(1)蛋白质分子对接打分函数的研究提出了两个打分函数。
3.
Based on the weighted amino acid network model,a new scoring function is constructed.
基于该加权氨基酸网络模型,构建了新的对接打分函数。
3) similarity scoring function
相似性打分函数
1.
Then,by use of similarity scoring function,β-hairpin motifs of supersecondary protein structure are recognized.
依据β-发夹氨基酸序列中的保守性特征,分别以氨基酸(20种氨基酸和一个空位)和氨基酸紧邻关联为参数,通过构建位置权重矩阵和选取氨基酸最佳序列模式片断,利用相似性打分函数,对蛋白质超二级结构β-发夹模体片断进行识别,获得了较好的预测效果。
4) PCSF
位置打分函数
1.
For the purpose of predicting the human polⅡ promoter and non-promoters,the frequencies of hexamer in three regions(-249～-1;0～+50;-30～+30) and the frequencies of trimer at 24 positions(-31～-21;-4～+2;+25～+29) are selected as parameters,respectively for increment of diversity(ID) and Position-correlation score function(PCSF).
通过选取人类启动子与非启动子序列中不同的k-mer作为预测算法的基础特征,分别以三个区域(-249~-1;0~+50;-30~+30)的6-mer频数作为离散源参数构建离散增量,同时选取24个位点(-31~-21;-4~+2;+25~+29)的3-mer频数作为位置打分函数的参数,分别利用支持向量机和马氏判别式为判别函数对启动子进行预测。
5) tunneling function
打洞函数
1.
A granular computing method based on global tunneling function
利用全局优化打洞函数的粒计算方法
6) position correlation-score function(PCSF)
位置关联打分函数
补充资料：[3-(aminosulfonyl)-4-chloro-N-(2.3-dihydro-2-methyl-1H-indol-1-yl)benzamide]
分子式：C16H16ClN3O3S
分子量：365.5
CAS号：26807-65-8
性质：暂无
制备方法：暂无
用途：用于轻、中度原发性高血压。
分子量：365.5
CAS号：26807-65-8
性质：暂无
制备方法：暂无
用途：用于轻、中度原发性高血压。
说明：补充资料仅用于学习参考，请勿用于其它任何用途。
参考词条