1．植物体无真根，仅具假根，2~3个孢子囊形成聚囊 ……………………………………松叶蕨亚门(Psilophytina)

1．植物体均具真根，不形成聚囊，孢子囊单生，或聚集孢子囊群。

2．植物体具明显的节和节间，叶退化成鳞片状，不能进行光合作用，孢子具弹丝………………………楔叶亚门(Sphenophytina)

2．植物体非如上状，叶绿色，小型叶或大型叶，可进行光合作用，孢子均不具弹丝。

3．小型叶，幼叶无拳曲现象。

4．茎多为二叉分枝，叶小形、鳞片状，孢子叶在枝顶端聚集成孢子叶穗，孢子同型或异型，精子具2条鞭毛 ………………………………石松亚门(Lycophytina)

4，茎粗壮似块茎，叶长条形似韭菜叶，不形成孢子叶穗，孢子异型，精子具多鞭毛………………水韭亚门(Isoephytina)

3．大型叶，幼叶有拳曲现象，孢子囊在孢子叶的背面或边缘聚集成孢子囊群。…………………真蕨亚门(Filicophytina)