国防医学院（national defense medical center，ndmc），或称国防医学中心，简称国医。创立于1902年，是中华民国军事院校中历史最悠久之学府。现址位于台北市内湖区。直属教学医院为三军总医院。
国防医学院于1949年迁台，以美式教育为主，与当时日式教育为主之台湾大学医学院，同为台湾早期医学教育及制度的奠基者。并于1958年，时任国防部长之蒋经国先生指示，协助成立台北荣民总医院及阳明医学院（今阳明大学）等退辅会之医学中心。
历史
1902年（清光绪28年）11月24日，袁世凯于天津东门外海运局创立北洋军医学堂，开始招收医科学生。
1906年（清光绪32年）移至天津黄纬路，更名为陆军军医学堂，负责人为陆军部军医司司长徐华清。
1912年（民国元年）更名为陆军军医学校，校长李学瀛为医科第一期毕业。
1936年（民国25年）更名为军医学校。校长张建为医科第15期毕业，德国柏林大学医学及哲学博士。
1947年（民国36年）于上海江湾改组为国防医学院，院长由军医署长林可胜兼任，第一副院长张建， 第二副院长卢致德。
1949年（民国38年）迁至台北市水源地。
1999年（民国88年）迁至台北市内湖区。
院歌
源远流长，桃李成荫，伟哉国防医学中心，八类六级。
日新又新，手脑并用，建国先健军。
建国健军，成功有赖力行。
惟勤惟奋，精益求精，亲爱精诚。
守我院训，努力向前，努力向前行！
学术单位
大学部
医学系，英文缩写为m。
药学系，英文缩写为p。
牙医学系，英文缩写为d。
护理学系，英文缩写为n。
公卫学系，英文缩写为ph。
通常以英文缩写后加上数字表示期别，如2006年入学者为m106、p93、d65、n59、ph27。
硕士班
生物及解剖学研究所
生理学研究所
药理学研究所
生物化学研究所
病理及寄生虫学研究所
公共卫生学研究所
护理学研究所
微生物及免疫学研究所
牙医科学研究所
药学研究所
海底医学研究所
航太医学研究所
博士班
医学科学研究所
生命科学研究所（与中央研究院、国家卫生研究院合办）
历任院长
林可胜中将（1947年6月～1953年） 福建海澄人，出生于新加坡，英国爱丁堡大学医学博士，协和医学院生理学教授，中央研究院院士，美国科学院院士。
卢致德中将（1953年～1975年9月） 广东中山人，协和医学院毕业，美国纽约大学医学博士，中央研究院院士。曾任台北荣民总医院创院院长。
蔡作雍(m47)中将（1975年10月～1984年3月） 美国哥伦比亚大学哲学博士，中央研究院院士。
潘树人(m39)中将（1984年3月～1989年8月）
尹在信(m49)中将（1989年3月～1991年12月）
马正平(m49)中将（1991年12月～1993年6月） 现任三军总医院泌尿外科顾问医师。
李贤铠(m59)中将（1993年7月～1996年6月） 美国哥伦比亚大学药理学研究所哲学博士，现任国防医学院药理学科教授。
沈国梁(m59)中将（1996年7月～2000年3月） 现任三军总医院一般外科主治医师。
张圣原(m66)将军（2000年4月～2002年9月） 现任康宁医院院长。
王先震(m66)将军（2003年6月～2005年8月） 现任台北市立万芳医院整形美容外科主任。
张德明(m74)将军（2005年9月～至今） 美国风湿学院（american college of rheumatology）院士。
著名师长
张先林 美国纽约大学医学博士，曾任国防医学院外科学系主任。
许雨阶
周美玉
文忠杰 美国纽约大学医学博士，曾任三军总医院外科部主任，台北荣民总医院首任外科主任。
王师揆
柳安昌
施纯仁 国立台湾大学医学院医科毕业，曾任三军总医院神经外科部主任、行政院卫生署署长、台大医学院、国防医学院教授。
知名校友
国防医学院超过百年历史，校友遍布医界。
m1~m50
邹济勋(m22) 曾任台北荣民总医院第二任院长。
于俊(m46) 曾任国立阳明医学院第二任院长。
周先乐(m47) 美国犹他大学药理学研究所哲学博士，曾任中国生理学会总干事。