复旦大学信息科学与工程学院成立于2000年5月，下设计算机科学与工程系、计算机与信息技术系、电子工程系、通信科学与工程系、光科学与工程系、微电子学系等6系。现有教职员工384人，其中院士4人，教授58人，副教授111人,其他职工211人。

信息学院现有学科覆盖六个一级学科，拥有博士后流动站3个（电子科学与技术、计算机科学与技术、生物医学工程）；博士点7个（微电子学与固体电子学、电路与系统、生物医学工程、 计算机软件与理论、计算机系统结构、计算机应用技术、光学）；硕士点12个（微电子与固体电子学、电路与系统、通讯与信息系统、生物医学工程、电磁场与微波技术、计算机软件与理论、计算机系统结构、计算机应用技术、光学、无线电物理、原子与分子物理、光学工程）。其中国家重点学科3个、上海市重点学科3个。信息学院现有国家重点实验室2个（复旦大学专用集成电路和系统国家重点实验室、复旦大学先进光子学材料与器件国家重点实验室），教育部重点实验室1个（教育部散射与遥感重点实验室），上海市重点实验室1个（上海市智能信息处理重点实验室）。

信息学院现有本科专业8个：电子信息科学与技术、微电子学、生物医学工程、计算机科学与技术、通讯工程、光信息科学与技术、信息安全、软件工程。

信息学院目前在计算机网络、数据库、并行处理、医学超声研究、专用集成电路设计、集成电路辅助设计、集成电路工艺、移动通信、光电子、光通信等领域内承接了大量的国家、省部委及上海市的科研项目，并获得了200余项国家、省部委级的科技成果奖。

信息学院与国内外信息公司、企业建有广泛的联系，ibm公司、intel公司、motorola公司、德州仪器公司、agilent公司、novellus公司、lucent technologies bell labs innovations、abest communication corp有限公司、日立公司、联想集团、上海通讯公司、上海华虹集团等均与学校建有联合实验室。