以色列指挥参谋学院设有陆军指挥参谋系、高级指挥系、陆军参谋短训队、海军系、空军系等5个系队。通过培训，进一步提高学员的三军合同作战、作战指挥、参谋业务、部队管理的能力。

以色列指挥参谋学院成立于1954年，是以色列国防军培养陆、海、空三军战役战术指挥及参谋人员（营至旅级）的专门院校。1991年前，学院直接隶属总参谋部作战部训练局。1991年体制调整后，改由国防学院院长领导。

以色列指挥参谋学院培养对象为具有晋升潜力的上尉至中校级军官。学员的选拔分为三个步骤：首先是各部队主官根据下属军官的表现，每年做出考核鉴定，并提出需要入学深造人员的名单；然后由总参谋部人力部专门设立的军官选拔委员会对部队主官提出的入学深造名单进行审查；三是指挥参谋学院院长根据人力部提出的入学名单对入学对象进行进一步的考核，并最后决定入学者的入学资格。

以色列指挥参谋学院教授战役战术课程。学院所设课程中，作战条令、指挥、编制、计划、控制、情况分析处理等作战指挥参谋科目的学习占55％；军事和安全理论、军事地理、军史等军事学术科目占30％；其他科目占15％。

以色列指挥参谋学院下设陆军指挥参谋系、高级指挥系、陆军参谋短训队、海军系、空军系等5个系队，主要设有两年制学士班（其中一年在地方大学就读）和3～5个月短训班两种学制。其中陆军指挥参谋系为两年制学士班，在学院的1年学习期间主要学习指挥控制课程。其课程侧重点为：作战指挥及控制、作战原则的实际运用、作战组织和决策过程、部队组织和参谋业务理论等。主要培养对象是无大学学历的上尉至中校级别军官。高级指挥系学制5个月，主要招生对象是已具有大学学历、即将提升到总部任职的部队营以上军官，教授课程包括军事原则、中高级作战指挥等，旨在使学员掌握旅、师级作战组织和合同作战方法，提高学员情况判断能力和分析决策能力。陆军参谋短训队学制7周，主要对各级参谋人员进行有关参谋业务的训练。空军系设有两年期的学士班（包括一年地方大学就读）和3个月短训班两种学制，分别招收无大学学历的空军飞行和地勤部队中级指挥参谋人员和已有大学学历的中级指挥参谋人员。课程设置包括基础知识、参谋和管理、指挥和领导等，主要目的在于提高学员的空军指挥参谋业务能力。海军系也设两年制学士班（包括一年地方大学就读）和15周短训班两种学制。分别招收没有大学学历的海军上尉至少校军官和有大学学历的少校至中校军官。课程包括海军指挥和参谋业务、作战指挥控制原则、国家安全战略、英语等。通过培训进一步提高学员的三军合同作战、作战指挥、参谋业务、部队管理等能力。

以色列指挥参谋学院教员的现役军官主要从有实践经验的部队指挥参谋人员挑选，一般任教3年后再回部队任职。个别毕业生留校的，也须具有部队实践经验，经院方审查批准。对特别突出的学员，学院可举荐到美、英、法、德等国军事院校继续深造。