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1)  DNA multiple sequence alignment
DNA多序列比对
1.
In order to solve the problems of both the alignment sequences number limitation and time-consuming which genetic algorithm will encounter in multiple sequence alignment, the authors propose a DNA multiple sequence alignment method based on genetic algorithm (GAMA).
为了克服遗传算法应用于多序列比对时所遇到的比对序列数受限制以及比对寻优速度慢的缺点,提出了一种基于遗传算法的DNA多序列比对方法(GAMA);针对DNA多序列比对的特点,指出了传统遗传算法中的交叉操作将为序列比对带来沉重的计算负担;避开遗传算法通常所采用的遗传操作算子,设计了独特的遗传算子(插入删除算子和合并分离算子)、基于BLAST相似度评分方法和完全比对块加权的个体适应度值评价函数,采用了便于插入和删除操作以及相似度评分的基于字符和空位矩阵的染色体编码方案。
2)  DNA sequence alignment
DNA序列比对
1.
The paper issues a improvement about BLAST algorithm which is a local parallel algorithm about DNA sequence alignment.
因此,对DNA序列比对进行并行化,以及对BLAST算法进行并行化改进,以提高对大数据量处理的能力。
3)  comparation of DNA homologous sequences
DNA同源序列比对
4)  multiple sequence alignment
多序列比对
1.
Two novel methods for multiple sequence alignments;
多序列比对的两种新方法
2.
A~*-based heuristic algorithm for multiple sequence alignment problem;
基于A~*算法的启发式算法求解多序列比对问题
3.
Multiple Sequence Alignment Algorithm Based on Sequence Structure Information;
基于序列结构信息的多序列比对算法
5)  multiple sequences alignments
多序列对比
1.
This paper systemically introduced each step of designing primers with the bioinformatics resource: searching for all sequence members of the gene, doing multiple sequences alignments, ascertaining the conservative region appropriately, designing the primers with the professional software, embellishing and examining the primers and so on.
系统介绍利用生物信息学资源设计引物的各个步骤 :搜寻某基因的所有已发表序列 ;对这些序列进行多序列对比 ,确定保守区域 ;利用专业软件设计引物 ;并对引物进行修饰和检测等。
6)  multiple alignment
多序列比对
1.
Research on multiple alignments for alternative splicing;
针对基因选择性剪接的多序列比对算法研究
2.
Hidden Markov model used in multiple alignment is a new field of bioinformatics.
隐马尔可夫模型(Hidden Markov model)用于多序列比对研究是生物信息学研究的新领域,其可以通过训练识别同一特征的蛋白质序列。
补充资料:简单重复DNA序列
分子式:
CAS号:

性质:又称简单重复DNA序列。是指DNA链内由2~4个核苷酸顺序串联重复排列的片段。广泛存在于真核生物基因中,可出现在基因编码区附近、非编码区或基因内。具有个体特征,是构成人基因组多态性的因素之一。其突变表现为重复顺序拷贝数的变化,而且有渐进累积的过程,突变频率与拷贝数有关。突变多数导致产生异常的蛋白质。已发现人类的五种遗传病与这种串联重复序列拷贝数变异有关:脆性X综合征、脊髓延髓肌萎缩症、强直性肌营养不良症、亨廷顿氏(Huntingtons)舞蹈病以及遗传性非息肉型结直肠癌等。

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参考词条