1) DNA sequence alignment
DNA序列比对
1.
The paper issues a improvement about BLAST algorithm which is a local parallel algorithm about DNA sequence alignment.
因此,对DNA序列比对进行并行化,以及对BLAST算法进行并行化改进,以提高对大数据量处理的能力。
2) DNA multiple sequence alignment
DNA多序列比对
1.
In order to solve the problems of both the alignment sequences number limitation and time-consuming which genetic algorithm will encounter in multiple sequence alignment, the authors propose a DNA multiple sequence alignment method based on genetic algorithm (GAMA).
为了克服遗传算法应用于多序列比对时所遇到的比对序列数受限制以及比对寻优速度慢的缺点,提出了一种基于遗传算法的DNA多序列比对方法(GAMA);针对DNA多序列比对的特点,指出了传统遗传算法中的交叉操作将为序列比对带来沉重的计算负担;避开遗传算法通常所采用的遗传操作算子,设计了独特的遗传算子(插入删除算子和合并分离算子)、基于BLAST相似度评分方法和完全比对块加权的个体适应度值评价函数,采用了便于插入和删除操作以及相似度评分的基于字符和空位矩阵的染色体编码方案。
3) comparation of DNA homologous sequences
DNA同源序列比对
4) sequence alignment
序列比对
1.
Ant colony algorithm based on intelligent altering pheromone for pairwise sequence alignment;
基于信息素智能更新的蚁群双序列比对算法
2.
Optimized biology sequence alignment algorithm;
一种优化的生物序列比对算法
3.
Overview of biology sequence alignment;
生物序列比对算法的简述
5) BLAST
[英][blɑ:st] [美][blæst]
序列比对
1.
The author analyzes the nucleotide distribution of essential genes and nonessential genes in Bacillus subtilis using the Z curve method and predicts the essential genes using the method of BLAST.
本文构建了必需基因数据库(DEG)以及探索必需基因数据库的可能应用,应用Z曲线方法分析了枯草杆菌(Bac illus subtilis)中必需基因和非必需基因的核苷酸分布,并且通过蛋白质序列比对的方法对大肠杆菌(E。
2.
This paper describes a little improvement in recognizing protein-coding genes in bacterial genomes using the Z curve method and also tries to use the BLAST to identify the essential genes in microbes.
本论文的主要内容是原核生物蛋白质编码基因识别以及通过序列比对的方法确定微生物的必需基因。
6) sequence alignment
序列对比
补充资料：简单重复DNA序列
分子式：
CAS号：
性质：又称简单重复DNA序列。是指DNA链内由2～4个核苷酸顺序串联重复排列的片段。广泛存在于真核生物基因中，可出现在基因编码区附近、非编码区或基因内。具有个体特征，是构成人基因组多态性的因素之一。其突变表现为重复顺序拷贝数的变化，而且有渐进累积的过程，突变频率与拷贝数有关。突变多数导致产生异常的蛋白质。已发现人类的五种遗传病与这种串联重复序列拷贝数变异有关：脆性X综合征、脊髓延髓肌萎缩症、强直性肌营养不良症、亨廷顿氏(Huntingtons)舞蹈病以及遗传性非息肉型结直肠癌等。
CAS号：
性质：又称简单重复DNA序列。是指DNA链内由2～4个核苷酸顺序串联重复排列的片段。广泛存在于真核生物基因中，可出现在基因编码区附近、非编码区或基因内。具有个体特征，是构成人基因组多态性的因素之一。其突变表现为重复顺序拷贝数的变化，而且有渐进累积的过程，突变频率与拷贝数有关。突变多数导致产生异常的蛋白质。已发现人类的五种遗传病与这种串联重复序列拷贝数变异有关：脆性X综合征、脊髓延髓肌萎缩症、强直性肌营养不良症、亨廷顿氏(Huntingtons)舞蹈病以及遗传性非息肉型结直肠癌等。
说明：补充资料仅用于学习参考，请勿用于其它任何用途。
参考词条