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1)  Single strand conformation polymorphism
单链构象多态性
1.
Detection of vector gene mutation by single strand conformation polymorphism with capillary electrophoresis;
毛细管电泳单链构象多态性分析检测质粒中基因突变
2.
Detection of Leber hereditary optic neuropathy using single strand conformation polymorphism analysis;
单链构象多态性分析检测Leber遗传性视神经病变
3.
Mutations of exon 1 and exon 7 were analyzed by single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products(PCR-SSCP).
方法分别应用免疫组化和聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术对62例膀胱癌及18例膀胱良性病变组织(对照组)中PTEN的表达及其第1和第7个外显子的突变情况进行检测。
2)  SSCP
单链构象多态性
1.
Single-Strand Conformation Polymorphism (SSCP) and Its Application in Entomolgy Research;
单链构象多态性(SSCP)及其在昆虫学中的应用
2.
Objective:To quickly detect two pathogenic bacteria strains of food poisoning by single strand conformation polymorphism (SSCP) assay.
目的 :利用单链构象多态性 (SSCP)对两起食物中毒的致病菌进行快速分析。
3.
ObjectiveTo detect five species food-borne pathogenic bacteria Salmonella typhimurium,Staphylococcus aureus,Escherichia coli,Shigellosis Flexneri Bacillus cereus to analyse single-strand-conformation polymorphism(SSCP) of the 16S rRNA gene,and investigate the possible role of this technology at rapid indentification of bacteria.
目的 对 5种常见食物中毒致病菌 16SrRNA基因单链构象多态性 (Single -strand -conformationpolymor phism ,SSCP)进行分析 ,探讨该技术在食物中毒致病菌快速鉴别诊断中的可能作用。
3)  single-strand conformation polymorphism
单链构象多态性
1.
The Effect of Different Gel Preparation on Detecting Mutation of AKT2 Gene by single-strand conformation polymorphism;
两种配制胶对单链构象多态性筛查AKT2基因突变的影响
2.
Application of restriction fragment length polymorphism and single-strand conformation polymorphism technique in differentiation of E.c oli serotype;
运用限制性长度多态性和单链构象多态性技术鉴别大肠杆菌血清型
3.
The leukocyte DNA was extracted and amplified by the polymerase chain reaction (PCR),and DNA sequence was analyzed by single-strand conformation polymorphism (sscp) and direct determine method.
通过外周血人基因组DNA提取,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增,非同位素标记单链构象多态性(SSCP)分析,硝酸银染色法及直接测序法。
4)  Single stranded conformational polymorphism
单链构象多态性
5)  PCR SSCP
单链构象多态性
1.
Methods MSI was analyzed by PCR SSCP method.
方法 应用PCR单链构象多态性 (PCR SSCP)技术检测微卫星DNA不稳定性。
2.
The Polymorphisms of IL 10 Promoter region were detected by PCR SSCP and sequencing.
用聚合酶链反应和单链构象多态性 ( PCR-SSCP)结合序列测定方法 ,检测了 66例健康对照 IL-1 0启动子区多态性的发生 。
6)  single-strand-conformation polymorphism(SSCP)
单链构象多态性技术
1.
In order to investigate microbial community structures in different wastewater treatment processes and understand the relationship between the structures and the status of processes,the microbial community diversity,variety and distribution in five wastewater treatment processes were studied by a culture-independent genetic fingerprinting technique single-strand-conformation polymorphism(SSCP).
为研究不同废水处理系统中微生物群落结构以及认识群落结构与系统处理效能的关系,采用单链构象多态性技术(SSCP)分别对稳定运行的脱氮除磷反应器(N),中药废水处理反应器(P),啤酒废水处理反应器(W),糖蜜废水发酵制氢反应器(H)以及硫酸盐还原反应器(S)等5种废水处理系统中的微生物群落结构进行了解析。
补充资料:单核苷酸多态性

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。snp在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。

snp所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的snp并不包括后两种情况。

理论上讲,snp既可能是二等位多态性,也可能是3个或4个等位多态性,但实际上,后两者非常少见,几乎可以忽略。因此,通常所说的snp都是二等位多态性的。这种变异可能是转换(c t,在其互补链上则为g a),也可能是颠换(c a,g t,c g,a t)。转换的发生率总是明显高于其它几种变异,具有转换型变异的snp约占2/3,其它几种变异的发生几率相似。wang等的研究也证明了这一点。转换的几率之所以高,可能是因为cpg二核苷酸上的胞嘧啶残基是人类基因组中最易发生突变的位点,其中大多数是甲基化的,可自发地脱去氨基而形成胸腺嘧啶。

在基因组dna中,任何碱基均有可能发生变异,因此snp既有可能在基因序列内,也有可能在基因以外的非编码序列上。总的来说,位于编码区内的snp(coding snp,csnp)比较少,因为在外显子内,其变异率仅及周围序列的1/5。但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义,因此csnp的研究更受关注。

从对生物的遗传性状的影响上来看,csnp又可分为2种:一种是同义csnp(synonymous csnp),即snp所致的编码序列的改变并不影响其所翻译的蛋白质的氨基酸序列,突变碱基与未突变碱基的含义相同;另一种是非同义csnp(non-synonymous csnp),指碱基序列的改变可使以其为蓝本翻译的蛋白质序列发生改变,从而影响了蛋白质的功能。这种改变常是导致生物性状改变的直接原因。csnp中约有一半为非同义csnp。

先形成的snp在人群中常有更高的频率,后形成的snp所占的比率较低。各地各民族人群中特定snp并非一定都存在,其所占比率也不尽相同,但大约有85%应是共通的。

snp自身的特性决定了它更适合于对复杂性状与疾病的遗传解剖以及基于群体的基因识别等方面的研究:

1、 snp数量多,分布广泛。据估计,人类基因组中每1000个核苷酸就有一个snp,人类30亿碱基中共有300万以上的snps。snp 遍布于整个人类基因组中,根据snp在基因中的位置,可分为基因编码区snps(coding-region snps,csnps)、基因周边snps(perigenic snps,psnps)以及基因间snps(intergenic snps,isnps)等三类。

2、 snp适于快速、规模化筛查。组成dna的碱基虽然有4种,但snp一般只有两种碱基组成,所以它是一种二态的标记,即二等位基因(biallelic)。 由于snp的二态性,非此即彼,在基因组筛选中snps往往只需+/-的分析,而不用分析片段的长度,这就利于发展自动化技术筛选或检测snps。

3、 snp等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是:首先选择参考样本制作标准曲线,然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较,根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。

4、 易于基因分型。snps 的二态性,也有利于对其进行基因分型。对snp进行基因分型包括三方面的内容:(1)鉴别基因型所采用的化学反应,常用的技术手段包括:dna分子杂交、引物延伸、等位基因特异的寡核苷酸连接反应、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术;(2)完成这些化学反应所采用的模式,包括液相反应、固相支持物上进行的反应以及二者皆有的反应。(3)化学反应结束后,需要应用生物技术系统检测反应结果。

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参考词条